maanantai 13. elokuuta 2007

Monday moods...

Maanataimieli mulla on...

Maanantai on yleensä aika tehokas päivä. Viikonlopun väsymys pukkaa päälle ainakin minulla vasta tiistaina, maanantain ajan käy vielä ihan hyvin viikonlopun höyryillä...

Tänään olenkin saanut väsättyä alustavan tutkimussuunnitelman (joskaan minulla ei ole hajuakaan millainen sen pitäisi olla...). Pyysin Mariaa lukemaan sen läpi, jos siinä on jotakin mitä voisi heti muuttaa ennen kuin lähetän Kirsille tarkastettavaksi. Kirsiltä oli tullut ihastuttava määrä vastauksia kaikenmoisiin epäselvyyksiini sähköpostilla, joten nyt on taas vähän turvallisempi mieli jatkaa.

Tutkimuksen runko alkaa pikkuhiljaa hahmottua, vaikka käytännön työohjeesta ei vielä ole tietoakaan. Kunhan tutkimussuunnitelma on hyväksytty, pidän proseminaarini ja alan väsäämään työohjetta itselleni. Kirjoittelen mieluummin selkeän työohjeen kuin räpellän ensin ja pohdin vasta sitten. Tässä samalla yritän tietysti kirjoitella ja muotoilla gradujohdantoa, jonka senkin saisin toivottavasti pian sellaiseen runkomuotoon, että Kirsi voisi sitä tarkastella.

Vilkaisin opintosuunnitelmaanikin tässä pitkilleen, ja havaitsin, että minulta puuttuu enää yksi käytävä kurssi, yhden kurssin tentti ja kaksi kirjatenttiä. Yritän aktivoitua niidenkin suhteen nyt heti tässä syksyllä, kun vielä intoa on. Jospa sen epäorgaanisen kemian kirjatentinkin saisi tehtyä, kun se on jo melkoisen monta vuotta roikkunut.

Sähköpostiin tuli muuten iloinen yllätys, kun maksettuani lukukausimaksun, vuosikurssini oli virallisesti merkitty kirjaimella N! Tätä N:nnen vuoden opiskelijuutta täytyy kyllä juhlistaa pikimmiten. Ja nyt saattaisi siis olla aika valmistuakin... :)

Taidan lähteä tietokoneostoksille, ja toivon kovasti, että tilaamani uusi työpöytäkin tulisi tänään. Pistän kotitoimistoni uuteen uskoon, ja siirryn varmaan sinne kirjoittelemaan graduakin, kun tämä työkone tökkii sen verran.

- Elina

maanantai 6. elokuuta 2007

Vielä on kesää jäljellä...

Ilmojen herra on tänä kesänä muistanut niin hyvällä kuin huonollakin, ja tietysti juuri nyt pitää muistaa hyvällä kun päätin palata graduni ääreen (ulkona on +25 ja aurinko paistaa)... Polkaisin aamulla yliopistolle ja valtasin tietokonepaikkani. Tämän päivän hommana ajattelin lukea tähänastisen gradusoperrukseni läpi, mutta niinhän siinä kävi että takerruin johdannon alkuun ja osoitin itsekunnioitusta deletoimalla koko roskan. Kirjoittelin vähän parempaan muotoon, ja nyt ensimmäisessä puolessa sivussa on jo jotakin järkeäkin, ehkä.

Loma on tehnyt hyvää, ja nyt on taas mukavaa uppoutua graduaiheeseen. Olen parin viime vuoden aikana todennut olevani sellainen ihminen, joka tarvitsee vähintään kuukauden latautuakseen uuteen työ- ja opiskelukauteen. Siispä olen käyttänyt viimeiset puolitoista kuukautta nukkumiseen, ulkoiluun, mökkeilyyn, retkeilyyn ja ultimaten pelailuun. Ihan helpolla kesästä ei ole kuitenkaan päästy, sillä musiikkirintama on pakottanut aktivoitumaan. Keikkoja on siunaantunut lähes joka viikonlopulle, ja treenejäkin on ollut kesän mittaan pari-kolme kertaa joka viikko, joten on tässä hommaakin ollut. Ja keikkaputki näyttää jatkuvan syksylle asti. Mutta eipä se mitään, itse on tämä tie valittu.

Jotta tulevasta graduvuodesta ei tulisi turhan löysä, ilmoittauduin läsnäolevaksi myös AMKiin, jonne sain musiikkipedagogiikalta paikan viime vuonna. Kirjoittelin kyllä heti sähköpostia opinto-ohjaajalle, ja saa nähdä millaisen opintosuunnitelman saan sinne aikaiseksi. Montaa kurssia ei kuitenkaan ole tarkoitus alkuun ottaa, koska tänä vuonna päätavoitteena on tämä gradu ja YO:lta valmistautuminen. Jos sitä ei voi sovittaa yhteen AMK-suunnitelmien kanssa, ilmoittaudun poissaolevaksi vielä täksikin vuodeksi. Mutta saa nähdä. Pianotunneille tekisi vaan mieli, kun alkavat nuo sormet jo natista ja ruostua...

Tämän viikon taidan vaan orientoitua työntekoon, kun on luvattu niin hyviä ilmoja. Toki yritän muutaman tunnin päivässä lukea ja kirjoittaakin. Ehkä ensi viikolla sitten täysipainoisemmin. Nooran kanssa käytiin alkukesästä Jokioisissa opiskelemassa alukkeiden suunnittelua käänteis-PCR:ää varten, ja sain siitä ihan hyviä ideoita omankin gradun kannalta. Nyt tiedän myös, keneen voin ottaa yhteyttä jos tulee ylitsepääsemättömiä ongelmia, mikä oli ehkä reissun paras anti.

Vähän tämä gradunteko jännittää, kun Kirsikään ei ole täällä. Artikkeleita olisi vaikka millä mitalla, ja tuntuu että niistä kaikista saa uusia (entisten kanssa ristiriitaisia) ajatuksia ja ideoita. Mutta on vain osattava poimia niistä olennaisin ja rakentaa oma tutkimus sen varaan. Tietty kokonaiskäsitys tutkimuksen vaiheista on jo muodostunut, mutta varsinkin käytännön työn suunnittelu tuntuu vielä kaukaiselta ajatukselta.

Jotta mRNA:n kvantitointi olisi mahdollista suoraan alkiolysaatista, on varmistettava, että RNA:ta on mahdollista monistaa spesifisesti suoraan lysaatista. Tämä vaatii sellaiset geenit, joille on mahdollista muodostaa alukkeet RNA-spesifisesti, eli RNA:lle suunnitellut alukkeet eivät saa tarttua alkion DNA:han monistaen sitä. Myös referenssigeenien on oltava tällaisia. AMK-lopputyössään Marika Lindström (2006) testasi beta-aktiin-mRNA:n monistusta alkiolysaatista, ja sai lupaavia tuloksia, joten taidan aloittaa tutkimukseni toistamalla tuon kokeen. Mikäli beta-aktiini-mRNA:n monistus on tosiaan spesifistä, yritän löytää pari muuta geeniä, joita voisin myös kokeilla. Mervi Jokioisista lupasi auttaa reaaliaikaisen PCR:n kanssa sitten kun tiedän, mitä testaan. Yksi mielenkiintoisista geeneistä olisi histoni 2A (H2A), jota voisi käyttää myös standardina kvantitatiivisessa kokeessa, mikäli monistus siitä onnistuu.

Nyt taidan palata hetkeksi artikkelin pariin ja sitten lähden pyöräilemään kohti huonekalukauppoja. Uusi työpöytä olisi saatava, kun nykyään työteko kotona tapahtuu hieman kyseenalaisissa paikoissa ja asennoissa...

Palataan siis!

- Kesätyttö Elina

perjantai 15. kesäkuuta 2007

Gradublogi alkaa

Tervetuloa ja moi!

Tämä on Elina Kemppaisen gradublogi, jolla on tarkoitus seurata gradun tavoitteiden toteutumista ja muuttumista, kirjoitusprosessia ja tutkimuksen etenemistä. Idea blogin pitoon tuli pedagogiikan kesäleiriltä (kiitos Kuopion yliopiston oppimiskeskuksen väelle loistavasta leiristä!).

Minä olen siis Elina, 23-vuotias soveltavan biotekniikan opiskelija
Kuopion yliopistossa. Viimeiset 1,5 vuotta olen työskennellyt yliopistolla assistenttina, mistä johtuen tämä graduntekokin on vähän viivästynyt... Tarkoitus olisi kuitenkin ensi lukuvuoden aikana saada se tehtyä. Graduprosessia ovat toki viivästyttäneet myös konservatorio-opinnot tässä rinnalla, mutta niistä täytyy todeta, että aika kivuttomasti on mennyt! Tosin papereitahan ei ole kourassa sieltäkään vielä, joten parempi olla turhaan manailematta elämän keveyttä.

Gradun aiheena on yksinkertaisen RT-PCR-menetelmän kehittäminen naudan munasolujen ja alkioiden geenien ilmentymisen tutkimukseen. Tarkoituksena on kirjallisuuskatsauksen avulla luoda tutkimussuunnitelma, jonka perusteella tehdään lyhyehkö laboratoriotutkimus ja raportoidaan tulokset. Alustavaa aikataulua tulen luomaan tänne myöhemmin.

Tällä hetkellä gradussani taitaa olla valmiina 27 sivua johdantoa, mutta ei se vielä painokelpoista tekstiä ole. Paljon on viilattavaa, ja tuntuu että olen saattanut kirjoittaa vähän liikaakin taustatietoa esim. naudan alkionkehityksestä; tutkimuksenihan liittyy kuitenkin enemmän geenien ilmentymiseen ja RT-PCR-menetelmään. Mutta kyllä jonkinnäköinen tausta on kerrottava, jotta tutkimuksesta saisi lukijakin mahdollisimman paljon irti.

Graduani ohjaavat FT Kirsi Kananen-Anttila, joka minun harmikseni juuri pakkasi tavaransa ja lähti uusien tuulien etsintään Tampereelle, ja professori Maria Halmekytö Biotieteiden laitokselta täältä Kuopiosta. Jospa tämä blogin pitäminen auttaisi myös yhteydenpidossa ohjaajani kanssa, koska tarve ohjaukseen on suurta, kun pitäisi perehtyä aivan uuteen menetelmään.

Toivon, että blogi auttaa minua myös ajatusten jäsentelyssä, aikataulun luonnissa, ideoiden ja ajatusten jakamisessa, ja jospa tämä ajatusvirta tarjoaisi ideansiemeniä jollekin muullekin. Toivon avointa kommentointia tekstiini ja ajatuksiini. Let the show begin!

Sen verran aikataulusta nyt ihan alkajaisiksi, että minulla on tänään viimeinen työpäivä, ja aion viettää heinäkuun lomaa. Mikäli into riittää, saatan rustata tutkimussuunnitemaani jo kesän aikana, mutta pyhitän ajan kyllä lomailulle. Elokuulta ajattelin aloittaa puurtamisen, ja tarkoitus olisi maisteriksi valmistua viimeistään ensi kesänä (2008).

Nyt vielä viimeiselle kahvitunnille (ja omenapiirakalle!) ennen lomaa, katsotaan milloin palataan. Kesämielellä sateesta huolimatta!

- Elinainen -